En Ubuntu 20.04 no se muestra el icono de Owncloud en la bandeja, el trayicon este:

y en las Aplicaciones al Inicio (autostart) no se pueden configurar líneas de comando con el símbolo “=“. Probé a configurar con “env ...” que en una Xubuntu vieja me había funcionado, pero no funciona.

La solución que encontré es la de crear un fichero owncloud-launcher.sh con permisos de ejecución r-x y el siguiente contenido:

Una vez configurado este fichero en Aplicaciones al Inicio, ya aparece el icono en la bandeja y automáticamente aparece minimizado.